Образовательное учреждение было открыто в 1983 году в соответствии с Постановлением ЦК КПСС и Совета Министров СССР от 22.09.1977г. №870 «О мерах по дальнейшему улучшению народного здравоохранения» по согласованию с Министерством здравоохранения СССР, на основании приказа Министерства здравоохранения РСФСР от 30.11.1983г. №705 и приказа Министерства здравоохранения Башкирской АССР от 13.12.1983 г. №1098-Д «Об открытии училища повышения квалификации работников со средним медицинским и фармацевтическим образованием в г.Уфе». С 1988 года решением коллегии Министерства здравоохранения РСФСР Училище утверждено базовым для Уральского региона, а с 1993 года решением коллегии Министерства здравоохранения Российской Федерации на основании приказа Министерства здравоохранения Российской Федерации от 02.08.1993г. № 178 «Об утверждении базовых училищ повышения квалификации работников со средним медицинским и фармацевтическим образованием и региональных центров системы непрерывного обучения специалистов среднего медицинского и фармацевтического звена» – региональным Центром для Поволжского региона. В 2003 году Училищу был присвоен статус Государственного образовательного учреждения «Центр повышения квалификации – Училище повышения квалификации работников со средним медицинским и фармацевтическим образованием» (приказ Министерства здравоохранения Республики Башкортостан от 23.01.2003 года №22-Д). С 01 ноября 2010 года распоряжением Правительства Республики Башкортостан от 24 сентября 2010г. № 1040-р «О создании государственного автономного образовательного учреждения Центр повышения квалификации – Училище повышения квалификации работников со средним медицинским и фармацевтическим образованием» изменен тип существующего государственного учреждения. На основании распоряжения Правительства Республики Башкортостан от 07.04.2014 года №296-р учреждение переименовано в государственное автономное учреждение дополнительного профессионального образования Республики Башкортостан «Центр повышения квалификации». Функции и полномочия учредителя Учреждения от имени Республики Башкортостан осуществляет Министерство здравоохранения Республики Башкортостан.

«Назад к природе!» – этот лозунг все более овладевает нашими умами. Доказательство этому - серии книг, циклы телепередач, многочисленные газеты и журналы с рецептами народной медицины. Популярный призыв легко можно применить к тому, чем уже почти три десятка лет занимается известный российский травник, кандидат биологических наук Михаил Гордеев. Травы – с душой и вовремя собранные добрыми людьми - несут в себе колоссальный заряд энергии, способны избавить от многих болезней и даже перестроить сознание. «Растворись в природе, прикоснись к ее благам, используй советы предков», - советует Михаил Викторович. И предлагает в наших фитоцентрах воспользоваться помощью специалистов, которые блестяще разбираются в травах. Сегодня в России создана сеть фитоцентров М.В. Гордеева, которая насчитывает более 15 филиалов в Уфе, Стерлитамаке, Москве, Санкт-Петербурге, Чебоксарах, Самаре, Набережных Челнах, Магнитогорске и др. городах. Фитоцентр оказывает помощь на основе оригинальных методик по лечению и профилактике, разработанных уфимской школой фитотерапевтов: гинекологических заболеваний (бесплодие, миомы, др.); заболеваний молочных желез (мастопатия и др.); мужских болезней (простатит, бесплодие, импотенция и др.); кожных заболеваний (псориаз, витилиго, диатезы и др.); эндокринных заболеваний (аутоиммунный тиреоидит и др.); заболеваний мочевыводящих путей (энурез, циститы, мочекаменная болезнь и др.); заболеваний нервно-психической сферы (тики, невриты и др.); заболеваний опорно-двигательного аппарата (остеопороз, артрозы, артриты и др.); а также другие малоизлечимые заболевания и состояния взрослых и детей. Фитоцентр обеспечивает своих пациентов широким выбором (более 500 видов) лекарственных трав, сборов, кремов, масел для лечения и профилактики различных заболеваний, а так же лечебно-косметическими средствами и свежими готовыми к употреблению в пищу пророщенными семенами различных культурных и целебных растений - как оздоровительного компонента в питании. В наших филиалах практикуют около 70 врачей из многих городов России, обучавшихся непосредственно у Михаила Викторовича и прошедшие под его руководством полевую практику.